1/256 финала

Нива - Славянск 2:1
Волочанин-Ратмир - Нефтяник Яр 0:2
Спартак Кс - Рыбинск +:-
Псков-747 - Кристалл См 1:0
Кристалл Дт - Динамо Бр 1:4
Шахтер Ш - Металлург КС 2:1 (доп. вр.)
Источник - СКА Р/Д 2:0
Русичи - Авангард К 3:1
Салют Бл - Металлург Лп 3:0
Фабус - Краснознаменск 0:2
Знамя Труда - Обнинск 1:0
Машиностроитель СП - Сатурн-2 1:0
Венец - Колос 0:1
АПК М - Таганрог 0:1
Динамо СПб - Сатурн-1991 +:-
ФК Гатчино - Пикалево +:-
Динамо Вг - Текстильщик 1:3 (доп. вр.)
Кавказкабель - Моздок 3:0
Астратекс - Волгарь-Газпром 1:0
Дербент - Анжи 1:2
Динамо-Имамат - Ангушт 1:0
Динамо П - Амкар 0:6
Динамо Мих - Спартак Тм 3:1
Салют Ср - Заводчанин 0:0 (6:7 пен.)
Академия - Волга Ул 4:1
Балаково - Мордовия 1:5
Спартак-Братский - Волгодонск 2:1
Олимп Кс - Машук-КМВ 2:0
Иристон Вл - Автодор 4:0
Бештау - Автозапчасть 0:6
Газовик Ор - Носта 0:1
Содовик - Магнитогорск 2:1
Планета - Ижевск 2:0
Нефтяник Пх - Зенит Пн 0:2
Метизник - Торпедо Ми 1:1 (1:4 пен.)
Трубник - Тобол Кр 1:2
Горняк Кч - Уралец -:+
Горняк Кш - Энергия Ч 0:2
Локомотив Е - Локомотив Лс 1:3
Турбостроитель - Рязань 0:0 (3:5 пен.)
Луч Т - Дон 1:0
Спартак Щл - Арсенал Т 1:0
Химик Дз - Торпедо Вл 2:1
Металлург Вк - Торпедо Пв 1:0
Спартак Й-О - Рубин 0:2
Прогресс З - Кристалл Сч 5:2
Монолит - Мосэнерго 2:1
ФК Чертаново - Красногвардеец 1:2
Торгмаш - Титан 1:1 (3:4 пен.)
Торпедо-Алттрак - Динамо Брл 1:1 (3:0 пен.)
Шахтер Пр - Металлург-Кузбасс 0:3
Междуреченск - Кузбасс 0:1
Виктория Н - Металлург-Енисей 5:2
Ока - Авангард-Кортэк 1:3 (доп. вр.)
Автомобилист - ФК ТРАСКО 6:0
Торпедо Арм - Кубань 2:1
Булат - Локомотив СПб 0:1
Томь - Иртыш 4:0
Динамо Ом - Югра 3:0
Иртыш Т - Звезда П +:-

1/128 финала

Красногвардеец - Монолит 0:0 (5:4 пен.)
Нефтяник яр - Спартак Кс 2:1 (доп. вр.)
Динамо Бр - Псков-747 1:0
Источник - Шахтер Ш 4:0
Русичи - Салют Бл 1:0
Краснознаменск - Титан 2:1
Металлург-Кузбасс - Торпедо-Алттрак 2:3
Кузбасс - Виктория Н 3:1 (доп. вр.)
Авангард-Кортэк - Знамя Труда 2:0
Автомобилист - Машиностроитель СП 2:0
Колос - Нива 5:1
Таганрог - Торпедо Арм 1:0
Океан - Сахалин Х +:-
СКА-Энергия - Динамо Як +:-
Селенга - Чита 1:1 (4:5 пен.)
Ангара - Звезда Ир 0:1
Динамо Спб - ФК Гатчина 0:1 (доп. вр.)
Локомотив СПб - Текстильщик 2:1
Кавказкабель - Астратекс 5:0
Анжи - Динамо-Имамат 2:0
Динамо Ом - Томь 0:1
Амкар - Иртыш Т 1:1 (5:3 пен.)
Заводчанин - Динамо Мих 0:1
Академия - Мордовия 2:1
Олимп Кс - Спартак-Братский 4:0
Автозапчасть - Иристон Вл 3:0
Носта - Содовик 2:0
Зенит Пн - Планета 1:0
Тобол Кр - Торпедо Ми 1:2
Уралец - Энергия Ч 2:2 (5:4 пен.)
Локомотив Лс - Рязань 3:0
Спартак Щл - Луч Т 4:3
Химик Дз - Металлург Вк 2:2 (5:4 пен.)
Рубин - Прогресс З 1:0

1/64 финала

Динамо Бр - Нефтяник Яр 1:0
Кузбасс - Торпедо-Алттрак 1:0
Томь - Амкар 4:0
Носта - Зенит Пн 2:0
Колос - Таганрог 3:0
Автозапчасть - Олимп Кс 0:0 (4:3 пен.)
Русичи - Источник 2:1
Красногвардеец - Краснознаменск 0:5
Авангард-Кортэк - Автомобилист 0:2
СКА-Энергия - Океан 2:1
Чита - Звезда Ир 3:1
Локомотив СПб - ФК Гатчина 1:0
Кавказкабель - Анжи 0:2
Академия - Динамо Мих 3:0
Торпедо Ми - Уралец 3:1
Локомотив Лс - Спартак Щл 3:1
Рубин - Химик Дз 5:1

1/32 финала

Локомотив Лс - Факел 1:3
Динамо Бр - Шинник 2:3
Русичи - Сокол 2:1
Краснознаменск - Сатурн 1:1 (3:4 пен.)
Кузбасс - Заря Л-К 0:1
Автомобилист - Арзамас 2:1 (доп. вр.)
Колос - Дружба М 1:2
Локомотив Чт - СКА-Энергия 1:1 (4:2 пен.)
Локомотив СПб - Зенит 0:1 (доп. вр.)
Анжи - Спартак Нч 8:0
Томь - Сибирь 7:0
Лада-Сок - Энергия 2:0
Автозапчасть - Динамо Ст 3:1
Носта - Нефтехимик 2:1
Торпедо Ми - Газовик-Газпром 2:0
Рубин - Лада 0:2

1/16 финала

Дружба М - Ростов 1:2 (доп. вр.)
Русичи - Жемчужина-Сочи 1:0
Заря Л-К - КАМАЗ 5:1
Локомотив Чт - Уралмаш 3:0
Зенит - Энергия-Текстильщик 5:0
Анжи - Алания 0:2
Томь - Крылья Советов 0:2
Торпедо Ми - Балтика 2:0
Носта - Локомотив М 1:2
Автозапчасть - Черноморец Н 2:1 (доп. вр.)
Лада - Локомотив НН 1:0
Факел - Торпедо 0:1
Лада-Сок - Ротор 2:3
Шинник - Динамо М 1:3
Сатурн - ЦСКА 0:2
Автомобилист - Спартак М 0:1

1/8 финала

Динамо М - Русичи 1:0
Спартак М - Ростов 4:1
Ротор - Автозапчасть 4:0
Локомотив М - Торпедо Ми 5:0
ЦСКА -Заря Л-К 0:0 (7:8 пен.)
Зенит - Локомотив Чт 0:0 (4:3 пен.)
Крылья Советов - Алания 1:0
Торпедо - Лада 6:1

1/4 финала

Заря Л-К - Динамо М 0:2
Спартак М - Зенит 0:1
Крылья Советов - Ротор 1:0
Торпедо - Локомотив М 1:2

1/2 финала

Динамо М - Зенит 1:0
Локомотив М - Крылья Советов 1:0

Финал

Локомотив М - Динамо М 2:0