1/256 финала

Немком - Шахтер Ш 3:0 (доп. вр.)
Славянск - Краснодар-2000 0:1
Спартак-УГП - Витязь Кр 0:1
Дружба М - Жемчужина-Сочи 4:1
Венец - Нарт Ч 0:2
Автодор - Моздок 6:0
Кавказкабель - Жемчужина Б 3:1
Ангушт - Терек 0:1
Спартак-Кавказтрансгаз - Динамо Ст 1:2
Астрахань - Динамо Мх 0:0 (3:4 пен.)
Энергия - Олимпия 0:5
Хопер - Искра Э 1:0 (доп. вр.)
Балаково - Зенит Пн 1:1 (3:4 пен.)
Академия - Волга Ул 0:1
Биохимик-Мордовия - Металлург Вк 0:1 (доп. вр.)
Химик Дз - Локомотив НН +:-
Волга НН - Торпедо Пв 1:0 (доп. вр.)
Спартак Й-О - Диана 0:0 (2:3 пен.)
Светогорец - Зенит-2 4:0
Волочанин-Ратмир - Псков-747 1:2
БСК - Уралан-ПЛЮС 1:0
Балтика - Мосэнерго 1:0
Нефтяник Яр - Динамо Вг 1:1 (2:3 пен.)
Рыбинск - Шексна 0:2
Автомобилист - Торпедо Вл 2:1
Спартак Кс - спартак-Телеком 2:1
Краснознаменск - Спортакадемклуб 1:0
Арсенал Т - Спартак Щл 3:0
Мострансгаз - Витязь 1:2
Титан - Сатурн-2 1:0 (доп. вр.)
Спартак Лх - Коломна 3:1
Фабус - Знамя Труда 3:2
Локомотив Кл - Арсенал-2 Т 1:0
Дон - Рязань 0:2
Спартак Тм - Локомотив Лс 2:1
Металлург Лп - Елец 3:1
Динамо Бр - Русичи 0:0 (7:8 пен.)
Авангард К - Салют Бл 1:2
Энергия Ч - Ижевск 1:0
КАМАЗ - Алнас 1:0
Динамо П - Динамо Кир 3:0
Уралмаш - Березники +:-
Челябинск - Нефтяник Уф 1:0
Спартак НН - Уралец 1:0
Содовик - Магнитогорск 2:0
Газовик Ор - Носта 1:0
Иртыш - Тюмень 1:2 (доп. вр.)
Сибирь - Кузбасс 1:0
Торпедо-Алттрак - Динамо Брл 1:1 (4:5 пен.)
Металлург-Кузбасс - Шахтер Пр 3:1
Селенга - Звезда Ир 1:2
Океан - Луч-Энергия 0:0 (5:4 пен.)
Чкаловец-Олимпик - Сибиряк 2:1
Амур - Смена 1:1 (4:5 пен.)

1/128 финала

Краснодар-2000 - Немком 1:0
Витязь Кр - Дружба М 0:1 (доп. вр.)
Нарт Ч - Автодор 0:2
Терек - Кавказкабель 0:0 (4:5 пен.)
Динамо Ст - Динамо Мх 0:0 (2:4 пен.)
Олимпия - Хопер 3:1
Волга Ул - Зенит Пн 2:1
Металлург Вк - Мордовия 0:0 (4:5 пен.)
Волга НН - Химик Дз 1:1 (4:5 пен.)
Диана - Энергетик 0:1
Псков-747 - Светогорец 2:1
БСК - Балтика 0:0 (3:4 пен.)
Шексна - Динамо Вг 1:2 (доп. вр.)
Спартак Кс - Автомобилист 1:1 (6:7 пен.)
Краснознаменск - Арсенал Т 3:0
Витязь - Титан 3:2
Фабус - Спартак Лх 0:1
Рязань - Локомотив Кл 1:0
Металлург Лп - Спартак Тм 2:1 (доп. вр.)
Салют Бл - Русичи 1:0
КАМАЗ - Энергия Ч 1:0
Динамо П - Уралмаш 2:5
Спартак НН - Челябинск 2:0
Газовик Ор - Содовик 1:1 (5:4 пен.)
Тюмень - Сибирь 0:1
Динамо Брл - Металлург-Кузбасс 1:0
Звезда Ир - чкаловец-Олимпик 1:0
Смена - Океан 1:0

1/64 финала

Псков-747 - Балтика 2:1
Динамо Вг - Автомобилист 0:1
Витязь - Краснознаменск 2:2 (2:4 пен.)
Рязань - Спартак Лх 2:1
Салют Бл - Металлург Лп 0:2
Уралмаш - КАМАЗ 1:0 (доп. вр.)
Газовик Ор - Спартак НН 1:2
Дружба М - Краснодар-2000 1:2
Кавказкабель - Автодор 1:2
Динамо Мх - Олимпия 3:1
Мордовия - Волга Ул 3:1
Энергетик - Химик Дз 2:0
Смена - Звезда Ир 3:2
Динамо Брл - Сибирь 1:2

1/32 финала

Рубин - Нефтехимик 3:1
Автомобилист - Химки 0:1 (доп. вр.)
Краснознаменск - Динамо СПб 1:5
Псков-747 - Кристалл См 1:2
Динамо Мх - СКА Р/Д 1:0
Волгарь-Газпром - Кубань 0:1
Краснодар-2000 - Черноморец Н 1:3
Автодор - Спартак Нч 0:0 (3:5 пен.)
Лукойл - Уралмаш 2:2 (1:3 пен.)
Лада - Факел 2:1
Мордовия - Энергетик 3:3 (1:3 пен.)
Сибирь - Локомотив Чт 2:0
Смена - Амкар 0:2
Газовик-Газпром - СКА-Энергия 2:6
Томь - Металлург-Енисей 2:0
Металлург Лп - Рязань 3:0

1/16 финала

Сибирь - Спартак М 0:4
Химки - Торпедо 1:0
Металлург Лп - Шинник 2:1
Динамо СПб - ЦСКА 3:2 (доп. вр.)
Кристалл См - Ростов 2:3
Кубань - Анжи 1:2
Черноморец Н - Крылья Советов 0:1
Спартак Нч - Динамо М 2:0
Уралмаш - Зенит 1:2
Лада - Москва 6:0
Энергетик - Сатурн 0:2
Рубин - Алания 1:0
Амкар - Уралан 1:3
СКА-Энергия - Сокол 0:1
Томь - Ротор 2:2 (4:2 пен.)
Динамо Мх - Локомотив М 1:2 (доп. вр.)

1/8 финала

Спартак М - Уралан 4:0
Металлург Лп - Химки 0:4
Динамо СПб - Ростов 2:3
Спартак Нч - Крылья Советов 0:1
Лада - Зенит 3:2 (доп. вр.)
Рубин - Сатурн 0:1
Томь - Сокол 0:1
Анжи - Локомотив М 1:0

1/4 финала

Химки - Ростов 0:1
Сокол - Спартак М 2:3
Лада - Сатурн 0:0 (3:2 пен.)
Анжи - Крылья Советов 1:1 (4:2 пен.)

1/2 финала

Анжи - Ростов 0:1
Лада - Спартак М 2:3 (доп. вр.)

Финал

Спартак М - Ростов 1:0