1/512 финала

Зеленоград - Кооператор 1:0
Маккаби Мск - Днепр См 0:3
Знамя Труда - Зоркий 1:2
Сатурн-2 - Пролетарий 5:1

1/256 финала

Олимпия - Текстильщик Км 3:1 (доп. вр.)
Ротор - Астрахань 1:0
Кавказтрансгаз-2005 - Энергия 0:2
Автодор - Динамо Ст 1:2
Таганрог - Батайск-2007 0:1 (доп. вр.)
Сочи-04 - Дружба М 2:1
Спартак-УГП - Краснодар-2000 1:2
Динамо СПб - Балтика-2 2:1
Волочанин-Ратмир - Зенит-2 3:1 (доп. вр.)
Волга Тв - Шексна 2:0
Спартак Кс - Динамо Вг 1:2
Спортакадемклуб - Реутов 1:2
Торпедо-РГ - Спартак Щл 1:0
Ника - Витязь 0:1
Звезда С - Луховицы 0:2
Елец - Дон 4:0
Губин - Локомотив Лс 0:2
Металлург Лп - Динамо Вр 0:1
Спартак Тм - Зенит Пн 1:2
Торпедо Вл - Зеленоград 3:0
Днепр См - Нара-ШБФР 0:1
Зоркий - Лобня-Алла 0:1
Рязань - Сатурн-2 0:0 (3:1 пен.)
Динамо Кир - Волга НН 2:0
Рубин-2 - Алнас 2:2 (4:5 пен.)
Волга Ул - Академия 3:2
Союз-Газпром - Нефтехимик 1:1 (5:4 пен.)
Челябинск - Тюмень 2:5 (доп. вр.)
Сокол - Юнит 0:2
Заря Л-К - Шахтер Пр 0:2
Амур - Чита 3:1 (доп. вр.)
Сахалин Ю-С - Смена 0:2

1/128 финала

Динамо Ст - Энергия 5:0
Батайск-2007 - Сочи-04 2:1
Олимпия - Ротор 0:3
Краснодар-2000 - Черноморец Н 1:2
Динамо СПб - Волочанин-Ратмир 1:2
Реутов - Торпедо Вл 1:3
Нара-ШБФР - Торпедо-РГ 2:1
Витязь - Лобня-Алла 1:1 (4:5 пен.)
Луховицы - Рязань 1:0
Локомотив Лс - Елец 2:0
Зенит Пн - Динамо Вр 2:1
Металлург-Енисей - Иртыш 0:0 (4:2 пен.)
Шахтер Пр - Динамо Брл 0:2
Сибиряк - Амур 0:2
Смена - Океан 2:1
Алнас - Динамо Кир 1:0
Лада - Волга Ул 2:3 (доп. вр.)
Юнит - Газовик Ор 1:4
Тюмень - Союз-Газпром 2:2 (4:2 пен.)

1/64 финала

Лобня-Алла - Луховицы 3:3 (6:7 пен.)
Локомотив Лс - Зенит Пн 0:0 (2:4 пен.)
Волга Тв - Волочанин-Рамир 1:0
Нара-ШБфР - Торпедо Вл 1:1 (2:4 пен.)
Смена - Амур 3:2
Вога Ул - Алнас 2:3
Газовик Ор - Тюмень 1:0
Черноморец Н - Батайск-2007 4:0
Ротор - Динамо Ст 1:1 (7:6 пен.)
Динамо Брл - Металлург-Енисей 0:0 (4:5 пен.)

1/32 финала

Волга Тв - Торпедо 0:0 (3:4 пен.)
СКА-Энергия - Звезда Ир 2:2 (5:4 пен.)
Металлург-Кузбасс - Сибирь 2:1
Содовик - Носта 0:1
Терек - Алания 2:0
СКА Р/Д - Машук-КМВ 1:0
Динамо Бр - Спартак-МЖК 1:0
Шинник - Текстильщик 1:1 (4:2 пен.)
Торпедо Вл - Балтика 0:0 (3:4 пен.)
Луховицы - Мордовия 6:0
Зенит Пн - Авангард К 1:2
Черноморец Н - Салют Бл 2:3
Ротор - Анжи 2:1
Алнас - КАМАЗ 1:3
Металлург-Енисей - Смена 3:1 (доп. вр.)
Газовик Ор - Урал 0:2

1/16 финала

СКА-Энергия - Сатурн 1:2
Металлург-Кузбасс - Кубань 1:2
Металлург-Енисей - Луч-Энергия 1:0
Носта - Москва 1:1 (2:4 пен.)
Урал - Локомотив М 1:0 (доп. вр.)
Терек - Спартак М 1:1 (4:3 пен.)
КАМАЗ - Крылья Советов 1:0
Авангард К - Динамо М 0:3
Салют Бл - Томь 0:0 (2:3 пен.)
Торпедо - Химки 1:2
Луховицы - Рубин 1:2
Шинник - Спартак Нч 1:2 (доп. вр.)
Динамо Бр - Зенит 1:4
СКА Р/Д - Ростов 0:3
Ротор - Амкар 1:4
Балтика - ЦСКА 0:1

1/8 финала

Амкар - Терек 3:1
КАМАЗ - Москва 0:1
Сатурн - Металлург-Енисей 2:1
ЦСКА - Химки 2:0
Ростов - Томь 0:1
Зенит - Динамо М 9:3
Кубань - Урал 2:3 (доп. вр.)
Спартак Нч - Рубин 3:2 (доп. вр.)

1/4 финала

Урал - Сатурн 2:1
Амкар - Москва 2:1
ЦСКА - Спартак Нч 2:1
Зенит - Томь 0:0 (3:4 пен.)

1/2 финала

Амкар - Урал 1:0
ЦСКА - Томь 2:1

Финал

ЦСКА - Амкар 2:2 (4:1 пен.)